Sau mỗi lượt giã nhẹ nhàng bằng chày cối, công đoạn tiếp theo và không thể thiếu là sàng cốm để phân loại và làm sạch thành phẩm. Quá trình sàng được thực hiện ngay lập tức sau khoảng mười nhát giã, nhằm tách hạt cốm đã tách vỏ ra khỏi trấu và những hạt còn nguyên vỏ. Người thợ dùng nia hoặc mẹt lớn, làm từ tre đan, mây.
Hỗn hợp cốm và trấu được đổ lên nia, sau đó người thợ thực hiện động tác sàng và sảy một cách điêu luyện. Họ lắc nhẹ và hất tung cốm lên, dựa vào trọng lượng khác nhau để phân tách:
Vỏ trấu và vụn cốm nhẹ sẽ bay ra ngoài hoặc được thổi đi (nhờ sức gió tự nhiên hoặc quạt).
Hạt cốm đã tách vỏ (thành phẩm) sẽ đọng lại ở giữa nia.
Những hạt còn vỏ (chưa được giã tách hoàn toàn) sẽ dồn lại ở mép hoặc góc nia, có trọng lượng nặng hơn.
Những hạt còn vỏ này sẽ được gom lại và cho vào cối để giã tiếp ở lượt sau. Quá trình giã và sàng cứ thế lặp đi lặp lại khoảng 7 đến 10 lần. Nhờ việc sàng lọc tỉ mỉ và liên tục này, người thợ không chỉ loại bỏ tạp chất mà còn phân loại được chất lượng cốm (cốm lá me, cốm rót), đảm bảo từng mẻ cốm cuối cùng đều sạch, đồng nhất về độ dẻo và màu sắc, sẵn sàng để được gói ghém và mang đi tiêu thụ.